Настоящий сборник основан на материалах докладов, представленных на очередном расширенном семинаре «Компьютерное моделирование актуальных задач», посвященном вычислительным технологиям в естественных науках, который проходил 3–5 июня 2009 г. в г. Таруса на базе гостиницы «Интеркосмос» Института космических исследований Российской академии наук. На первом семинаре из данной серии рассматривалось компьютерное моделирование актуальных задач физики и механики, его труды изданы в 2009 г. в выпуске 1 сборника (Труды Семинара по вычислительным технологиям в естественных науках. Вып. 1. Вычислительная физика / Под ред. Р.Р. Назирова. М.: КДУ, 2009. 288 с.). Второй выпуск посвящен обсуждению физических и медицинских аспектов исследования сложных нелинейных физических процессов в организме человека (Методы нелинейного анализа в кардиологии и онкологии: Физические подходы и клиническая практика. Вып. 2 / Под ред. Р.Р. Назирова. М.: КДУ, 2010. 206 с.). Третий выпуск посвящен компьютерному моделированию задач биологии и химии. В последние годы сформировалась область научной деятельности, которую ряд исследователей называет третьим столпом естествознания. Это третье направление получения знания, дополнительное к теории и эксперименту, основано на применении вычислительных (компьютерных) технологий как основного инструмента и развивается на стыке прикладных математических методов и области применения этих методов. Очевидно, что такое развитие требует специальных познаний из нескольких областей знания, и успех зависит от эффективности применения и математических методов, и методов специфической области исследования. Это определяет сложность формирования такого направления и требует повышенного внимания к его развитию.